苏州大学附属儿童医院中医科（中西医结合内科）成立已久，现有医护人员11人，其中主任医师2人，主治医师2人，住院医师6人，推拿技师1人。科室医师均为硕士以上学历，其中博士3人，硕士6人。目前科室已形成以中西医结合治疗小儿内科疾病为中心，突出中医外敷、推拿等外治疗法为特色的专科门诊，坚持科研与临床相结合，主持参与国家自然科学基金1项，省中医药管理局课题2项，苏州市课题5项。

中医科主要采用中西医结合方法治疗小儿内科疾病，对小儿急性上呼吸道感染、急性支气管炎、肺炎、过敏性鼻炎、鼻窦炎、慢性咳嗽、反复呼吸道感染等呼吸系统疾病；厌食、腹泻、腹痛、便秘等消化系统疾病；此外遗尿、多汗症、过敏性紫癜、抽动症等疾病的中西医治疗均有确切疗效,开设小儿推拿门诊。

针对小儿服药困难的问题，中医科特别开展了中药穴位贴敷和小儿推拿等外治疗法。中药穴位贴敷治疗小儿咳嗽、肺炎、反复呼吸道感染、腹泻、便秘、多汗、遗尿、流涎、口疮等疗效显著，特别是夏季三伏贴、冬季三九贴治疗反复呼吸道感染、过敏性鼻炎、哮喘等得到了患儿家长的广泛认可。小儿推拿运用各种手法刺激穴位，使经络通畅、气血流通以调整阴阳，扶正祛邪，对于小儿泄泻、便秘、食积、厌食、腹痛、脱肛、发热、咳嗽、遗尿、夜啼、肌性斜颈、落枕、惊风等疾病有显著疗效。