苏州大学附属儿童医院呼吸科于1959年，由首任院长陈务民教授创建。目前为江苏省临床重点专科、苏州市临床重点学科。80年代起先后由“南盛北陈”之称的盛锦云教授、季伟教授、郝创利先后等带领呼吸科进一步发展。现有医生29人，高级职称14名，其中医学博士5名，有博士生导师5名、硕士生导师3名。近五年累计承担国家、省市各级各类课题15项，获省、市科技进步奖和医学新技术引进奖近30项，发表科研论文150余篇，其中SCI论文52篇。学科中有中华医学会变态反应分会委员、中华医学会变态反应儿童过敏和哮喘学组副组长等任职10人次；江苏省医学会变态反应分会候主任委员、委员；江苏省医学会儿科学分会呼吸学组组长；苏州市变态反应分会主任委员；苏州市医学会儿科学分会呼吸学组组长等，多人担任《中国实用儿科杂志》、《临床儿科杂志》、《中华实用儿科临床杂志》等编委。

苏州大学附属儿童医院心呼吸科位于景德路院区，现已经发展为3个病区（核定床位127张）、1个哮喘中心、1个睡眠中心和1个儿童呼吸疾病苏州市重点实验室。年收治患儿6400余例，患者来自于全国各地。科室拥有婴幼儿和儿童肺功能仪、日本奥林巴斯和富士能电子支气管镜、呼出气体一氧化氮检测定仪，能开展的优势项目：呼吸道感染多病原联合检测、支气管哮喘、慢性咳嗽及过敏性疾病规范化诊疗、婴幼儿、儿童支气管镜检查、异物取出及支气管肺泡灌洗术、婴幼儿及儿童肺功能检测、支气管激发试验和支气管舒张试验、呼出气NO及诱导痰检测、CT引导下肺穿刺、多导睡眠监测等。在儿童呼吸系统疾病的诊治方面积累了丰富的临床经验，整个学科在江苏乃至全国都有较大影响。

2018年呼吸科成功引进钟南山院士团队，在成人呼吸平台基础上建立儿童呼吸疾病的精准治疗，同年9月获批成为首家国家呼吸系统疾病临床研究中心分中心。进一步进行儿童呼吸道感染的病原学研究、支气管哮喘的临床和基础研究、儿童慢性咳嗽的临床和基础研究、儿童OSAHS的临床和基础研究。将代谢组学和临床生化指标整合、与基因组学整合、与基因通路整合，针对疾病建立用于疾病的早期预警、临床诊治、个性化用药、疾病预后以及药物评价的整合生物标志物的系统，进一步实现儿童呼吸疾病的精准化诊疗。并力争将苏州大学附属儿童医院呼吸科打造成为国家呼吸疾病临床研究中心区域中心。